恩施州中心医院开设临床和医技科室59个，拥有眼科中心、心胸外科、儿科、心血管内科、临床输血科、口腔科、护理、临床检验、超声诊断、中医骨伤、中医肺病、感染性疾病科等科室。
恩施州中心医院烧伤整形科是州内及周边地区专业性较强，设备先进，集烧伤、整形、医疗、美容为一体的规范性综合治疗及服务中心。医院烧伤治疗始于60年代初期，98年医院正式创立全州的烧伤整形专科。拥有专业医护人员18名，其中主任医师1名，主治医师4名。
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